En las últimas dos décadas, en Iztacalco, como en la mayoría de las alcaldías, el PRD dominó las urnas los primeros periodos electorales. Hecho que cambio tras el surgimiento de Morena, quien gobernó los últimos seis años.
La primera alcaldesa de Iztacalco fue Elena Tapia, quien ganó en el 2000, con 37.80% de las preferencias y una ventaja de 13,717 votos. 2003 fue el año que Armando Quintero ganó por primera vez las eleciones como candidato del PRD y una ventaja de 31.63% (46,626 votos) de diferencia. Aunque la ventaja fue amplia, Erasto Ensástiga la superó en 2006 tras ganar frente al panista, Juan Manuel Rayón, con una ventaja de 33.07%, equivalente a 78,110 votos.
Tras nueve años, donde gobernó Francisco Javier Sánchez, Elizabeth Mateos y Carlos Estrada, todos militantes de PRD, Armando Quintero volvió a ganar las elecciones en 2018; sin embargo, esta vez lo hizo como candidato de Morena-PT-PES. No conforme, en 2021 buscó la reelección y la ganó con 36.97% de los votos y una ventaja de 26,022 votos.
Sin embargo, debido a que el PES perdió su registro en la CDMX, sólo compitió por Morena–PT. Iztacalco es, por ahora, la única localidad, además de Cuajimalpa, que ha tenido el mismo alcalde tres veces.